Com ampla experiência na gestão pública, Pantoja foi assessor jurídico da Secretaria Municipal de Gabinete Civil entre agosto de 2022 e maio de 2024. Também exerceu o cargo de subsecretário de Gestão e Planejamento da Secretaria Municipal de Mobilização e Participação Popular (Semopp) entre maio de 2024 e janeiro de 2025, retornando ao Gabinete Civil como assessor especial de janeiro a março deste ano.
À frente da Semed, ele pretende modernizar e implementar novas tecnologias, com foco na otimização da gestão escolar municipal, que, desde janeiro de 2021, já entregou 40 escolas e creches novas ou completamente reconstruídas.