Segundo a presidente da Fundação, Gisela Cezimbra, a instituição é vinculada à Secretaria de Saúde, mas tem autonomia para gerenciar unidades hospitalares com mais agilidade. Esse modelo já existe há mais de uma década em outros estados e, no Amapá, tem apresentado avanços significativos na gestão do Anexo do Hospital de Emergência, Unidade Estadual de Internação, UPA Zona Sul e Hospital Regional de Porto Grande. Em dois anos, mais de 70 mil atendimentos foram realizados.

A modernização hospitalar também tem sido uma prioridade, com a aquisição de equipamentos de ponta, como o carro de anestesia A9, com inteligência artificial, usado no Hospital Regional de Porto Grande. Além da tecnologia, a Fundesa investe em humanização, adotando práticas como musicoterapia e passeios terapêuticos para pacientes, além de programas de bem-estar para profissionais de saúde. O compromisso da fundação é garantir um atendimento mais ágil, eficiente e acolhedor para a população amapaense.